為保持潔凈車間的凈化效果，必須對其進行清洗。
在潔凈車間，對主、支風管道清潔組的工作進行監督管理，對潔凈車間的組員進行施工技術指導。清潔風管應分區域、分階段進行，清潔車間的清潔工作段和非清潔工作段之間，清潔風管和連通室內區域之間，應采取有效的空氣隔離措施(即針對問題的解決辦法)。
二、對零件清洗組的工作監督管理，指導組員施工技術，用專用工具、器械對零件進行清洗，清洗后零件達到相關標準要求，零件可直接清洗，或拆下后進行清洗，清洗后零件要恢復原位，可調零件也應恢復原位。
三、清潔車間，對組的工作進行監督管理，指導組的施工技術和嚴格的標準，清潔達到相應衛生要求后，對管道、部件和冷卻塔進行處理，并做好記錄。氣道時，將噴頭安裝在清洗機器人上，讓劑通過機被送到噴頭，噴霧從內部向外部噴出，邊退邊噴，這樣可以避免再污染。藥劑的選擇是在保證效果的前提下，對風管和設備傷害較小，必要時后要及時沖洗通風，防止液殘留對人體和設備造成危害。
四、監督管理凈化車間冷卻塔清潔隊的工作，指導清潔隊施工工藝。無塵室車間空氣常溫除塵，高溫空氣凈化，空氣過濾，在工作場所吸塵。適用行業：木制品、橡膠、塑料、采礦、玻璃陶瓷、顏料、電子、醫藥、紡織印染、電鍍、機械制造、化工、鋼鐵冶煉、化肥農藥等。先排出冷卻水，再對冷卻塔內壁進行徹底清洗，達到表面無污染物。若在冷卻水中發現致病微生物，則先用化學方法或劑處理冷卻水，再將塔內水排出，并對塔內壁進行徹底清洗。
公司應合理安排人員定期清洗、管理，并將其責任落實到人，以確保車間的潔凈度。無塵車間潔凈度和持續穩定的污染控制是檢驗無塵車間質量的核心標準，依據區域環境、凈化程度等因素，分為幾個等級，常用的有國際標準和國內區域工業標準，一些知名無塵工程公司，在通行標準之外，還有自己執行的凈化指標高于國際通行標準，凈化能力和環境適應力遠超國際品牌。清潔車間凈化廠房內墻、頂板一般多采用50mm厚的夾心彩板制作，其特點是美觀，剛性強?；⌒谓?、門、窗框等一般采用專用氧化鋁型材，地面可采用環氧自流式平地或耐磨塑料地板，如有防靜電要求，可選用防靜電型。
